Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1aQ99L02 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms