Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed9Q99KF1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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