Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf11Q99JX1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Taf11Q99JX1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms