Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GatbQ99JT1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms