Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim7Q923T7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim7Q923T7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim7Q923T7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms