Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg13Q91YI1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Atg13Q91YI1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Atg13Q91YI1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Atg13Q91YI1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Atg13Q91YI1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Atg13Q91YI1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Atg13Q91YI1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atg13Q91YI1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atg13Q91YI1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atg13Q91YI1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atg13Q91YI1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg13Q91YI1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms