Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cul7Q8VE73 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cul7Q8VE73 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cul7Q8VE73 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms