Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
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Rapgef3Q8VCC8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
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Rapgef3Q8VCC8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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Rapgef3Q8VCC8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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Rapgef3Q8VCC8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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Rapgef3Q8VCC8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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Rapgef3Q8VCC8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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Rapgef3Q8VCC8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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Rapgef3Q8VCC8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef3Q8VCC8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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Rapgef3Q8VCC8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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Rapgef3Q8VCC8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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Rapgef3Q8VCC8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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Rapgef3Q8VCC8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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Rapgef3Q8VCC8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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Rapgef3Q8VCC8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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Rapgef3Q8VCC8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef3Q8VCC8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
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