Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc9Q8VC31 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc9Q8VC31 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc9Q8VC31 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms