Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3F9

Tut1, Speckle targeted PIP5K1A-regulated poly(A) polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tut1Q8R3F9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tut1Q8R3F9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tut1Q8R3F9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tut1Q8R3F9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tut1Q8R3F9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tut1Q8R3F9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tut1Q8R3F9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tut1Q8R3F9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tut1Q8R3F9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tut1Q8R3F9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tut1Q8R3F9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tut1Q8R3F9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tut1Q8R3F9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms