Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2f4Q8R0K9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f4Q8R0K9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f4Q8R0K9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms