Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZZ7

Tprkb, EKC/KEOPS complex subunit Tprkb, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TprkbQ8QZZ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TprkbQ8QZZ7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TprkbQ8QZZ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms