Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stn1Q8K2X3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stn1Q8K2X3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms