Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Depp1Q8K2F3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms