Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd3Q8K1Y2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1574.3 ms