Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot3Q8K0V4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot3Q8K0V4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms