Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SbsnQ8CIT9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SbsnQ8CIT9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms