Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cc2d2aQ8CFW7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cc2d2aQ8CFW7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cc2d2aQ8CFW7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Cc2d2aQ8CFW7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms