Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp27Q8CEG8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Usp27Q8CEG8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Usp27Q8CEG8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Usp27Q8CEG8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Usp27Q8CEG8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms