Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrrc9Q8CDN9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrrc9Q8CDN9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrc9Q8CDN9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms