Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riox2Q8CD15 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riox2Q8CD15 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms