Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf12Q8C8K3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf12Q8C8K3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms