Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
N4bp3Q8C7U1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
N4bp3Q8C7U1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms