Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C708 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C708 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C708 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C708 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C708 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C708 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C708 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C708 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C708 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C708 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C708 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C708 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C708 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C708 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C708 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C708 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C708 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C708 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C708 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C708 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C708 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C708 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C708 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C708 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C708 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C708 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C708 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C708 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C708 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C708 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C708 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C708 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C708 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C708 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C708 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C708 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C708 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C708 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C708 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C708 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C708 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms