Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC049762Q8C601 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms