Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q8C1R3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q8C1R3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q8C1R3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C1R3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C1R3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q8C1R3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms