Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYM7

Rsph4a, Radial spoke head protein 4 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph4aQ8BYM7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rsph4aQ8BYM7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph4aQ8BYM7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph4aQ8BYM7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms