Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms