Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUV3

Gphn, Gephyrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GphnQ8BUV3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GphnQ8BUV3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GphnQ8BUV3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GphnQ8BUV3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms