Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpc2Q8BKV1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpc2Q8BKV1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpc2Q8BKV1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms