Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX3

Lrtm2, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm2Q8BGX3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm2Q8BGX3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms