Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH2

Samm50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samm50Q8BGH2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Samm50Q8BGH2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Samm50Q8BGH2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms