Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Thnsl2Q80W22 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Thnsl2Q80W22 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms