Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms