Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul9Q80TT8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul9Q80TT8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul9Q80TT8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul9Q80TT8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul9Q80TT8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cul9Q80TT8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cul9Q80TT8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cul9Q80TT8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cul9Q80TT8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cul9Q80TT8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul9Q80TT8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms