Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna12Q80SS5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna12Q80SS5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms