Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms