Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc93Q7TQK5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms