Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vma21Q78T54 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms