Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snd1Q78PY7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snd1Q78PY7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snd1Q78PY7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms