Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms