Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp34Q6ZQ93 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms