Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
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Tcaf3Q6QR59 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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Tcaf3Q6QR59 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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Tcaf3Q6QR59 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcaf3Q6QR59 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tcaf3Q6QR59 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Tcaf3Q6QR59 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Tcaf3Q6QR59 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcaf3Q6QR59 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Tcaf3Q6QR59 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcaf3Q6QR59 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcaf3Q6QR59 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcaf3Q6QR59 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcaf3Q6QR59 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcaf3Q6QR59 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Tcaf3Q6QR59 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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