Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca4aQ6Q473 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms