Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc57Q6PHN1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms