Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ttbk1Q6PCN3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ttbk1Q6PCN3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ttbk1Q6PCN3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Ttbk1Q6PCN3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
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