Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atl2Q6PA06 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl2Q6PA06 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms