Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcnpQ6P8I4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms