Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms