Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrimpolQ6P1E7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrimpolQ6P1E7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms